m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動態(tài)發(fā)布時間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一，目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機(jī)制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章，小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理，作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理，然后再對打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫測序。對于無修飾的位點，ACA處被完全剪切，測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進(jìn)行分析（圖3）。動物疾病模型在科研中有著普遍的應(yīng)用。天津乳鼠科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建

    如胰腺，一般取胰島較多的胰腺尾部；肺應(yīng)取有細(xì)支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實驗需進(jìn)行多樣本的采集，采集順序應(yīng)按照：消化，神經(jīng)系統(tǒng)，皮膚，肌肉等的順序進(jìn)行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排，然后決定其切面的走向；如一長管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周圍的脂肪等，應(yīng)盡可能掉，否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來一些不必要的問題。樣品的固定（1）固定的方法：①小塊固定法：從動物取下的小塊，立即置入液態(tài)固定劑（這是應(yīng)用經(jīng)常的方法）。②注射/灌注固定法：某些塊由于體積過大或固定液極難滲入內(nèi)部或需要對整個臟器或整個動物進(jìn)行固定，這時宜采用注射固定法，將固定液注入血管，經(jīng)血管分支到達(dá)整個和全身，從而得到充分的固定。另，空腔比如肺，肺內(nèi)含有空氣，固定液難以滲入，建議先做肺灌注，使得肺充盈滿固定液以后再進(jìn)行保存，如果空腔中氣體沒有排出，后續(xù)可能影響固定效果（沒有灌注的肺會浮在液體表面不利于固定，切片以后也會看到很多的空泡）。③蒸汽固定法：比較細(xì)小而薄的標(biāo)本，可用鋨酸或甲醛蒸汽固定。主要用于血液或細(xì)胞涂片以及某些薄膜的固定。。海南小鼠科研技術(shù)服務(wù)實驗室EdU細(xì)胞增殖檢測是一種快速、準(zhǔn)確、靈敏的細(xì)胞增殖檢測方法.

    外泌體的功能外泌體可能作為細(xì)胞之間物質(zhì)和信號通訊的途徑，不同的細(xì)胞通過分泌攜帶不同組分的外泌體實現(xiàn)細(xì)胞間通訊，這些外泌體被受體細(xì)胞吸收，通過物質(zhì)交換或釋放內(nèi)含物實現(xiàn)物質(zhì)和信號的交流。外泌體與受體細(xì)胞的信息交流可能通過以下4種途徑實現(xiàn):外泌體表面膜蛋白質(zhì)被目的細(xì)胞表面的受體識別，從而靶細(xì)胞;外泌體在蛋白酶作用下產(chǎn)生的表面膜蛋白質(zhì)碎片可作為目的細(xì)胞表面受體的配體;外泌體脂膜可以與目的細(xì)胞膜融合，將蛋白質(zhì)和RNA等內(nèi)容物釋放進(jìn)去，此類膜融合可能改變靶細(xì)胞的一些膜特性，例如脂質(zhì)和膜蛋白質(zhì)的密度及種類;目的細(xì)胞通過胞吞的形式攝入外泌體經(jīng)由以上幾種途徑，外泌體將其攜帶的生物信息運輸?shù)街苓叞屑?xì)胞或經(jīng)血液等體液運輸而被遠(yuǎn)處組織細(xì)胞攝取，進(jìn)而影響目的細(xì)胞的基本功能和基因表達(dá)。幾乎所有的細(xì)胞都可以在自發(fā)或在一定刺激條件下產(chǎn)生外泌體，不同的細(xì)胞產(chǎn)生的外泌體具有不同的功能，這些外泌體參與了一系列生理和病理過程，如發(fā)生與發(fā)展、抗原呈遞、免疫調(diào)節(jié)、組織愈合等。此外，外泌體與疾病的研究表明：外泌體可能在代謝性疾病的出現(xiàn)以及心血管健康中發(fā)揮作用。

    代謝組學(xué)的研究對象大都是相對分子量在1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)，因此常用的血液樣本在取樣后，應(yīng)小心操作，防止溶血，盡快分離出血清，分置于溫環(huán)境下保存。由于用于理實驗的動物采集相對其他樣品的采集，操作更繁瑣，在處理過程中許多細(xì)節(jié)容易忽略，造成數(shù)據(jù)不完美（甚至不能用）。因此接下來將重點介紹樣品采集的注意事項及其固定。樣品采集注意事項應(yīng)新鮮，操作時間盡可能短，否則細(xì)胞發(fā)生死后變化、自融及現(xiàn)象。是動物心臟還在跳動時采集，樣本取出后在5分鐘以內(nèi)置于固定液內(nèi)，避免長時間暴露在空氣環(huán)境中。塊盡量小而薄。塊的厚度以不超過5mm為宜，較為理想的厚度為2mm左右，主要目的是使固定液迅速而均勻的滲入塊內(nèi)部。勿使塊受擠壓。在采集過程中，應(yīng)盡量選擇較為鋒利的手術(shù)，如手術(shù)刀片等，避免操作過程中擠壓挫傷標(biāo)本。擠壓過的均不可用。固定液的量一般以塊大小的20倍為宜，能夠在容器內(nèi)自由移動。盡量保持的原有形態(tài)。新鮮經(jīng)固定后，或多或少產(chǎn)生收縮現(xiàn)象（如胃腸），為此可將展平，以盡可能維持原形。保持清潔。塊上如有血液、污物、粘液、食物、糞便等，可用生理鹽水沖洗，然后再入固定液，但要注意防止損傷。要熟悉采集部位。要能準(zhǔn)確的按解剖部位采集。實驗技巧——做好細(xì)胞凍存，保證細(xì)胞質(zhì)量。

    痙攣型腦性癱瘓(SCP)大鼠模型【簡介】痙攣性腦癱指發(fā)育異常引起的運動和感覺功能落后，造成肢體肌張力增高、腱反射亢進(jìn)等一系列綜合征。本實驗利用腦立體定位解剖圖譜,對大鼠的錐體束部位進(jìn)行精確的立體定位,通過微量注射器對大腦錐體束所在部位注射無水乙醇造成錐體束壞死,的模擬了痙攣型腦癱的解剖學(xué)及病理改變,術(shù)后大鼠產(chǎn)生明顯的屈曲痙攣癥狀,且屈肌肌張力增高,癥狀和體持續(xù)時間較長,穩(wěn)定性良好。從而建立一種可復(fù)制性良好且痙攣持續(xù)時間較長的穩(wěn)定的大鼠痙攣型腦癱動物模型,為進(jìn)一步深入的探究痙攣型腦癱的基礎(chǔ)研究和臨床診治打下基礎(chǔ)【目的】痙攣型腦性癱瘓(SCP)大鼠模型建立【動物】SPF級SD大鼠，雄性，周齡6~8W，體重：200~250g【方法】1、大鼠麻醉，顱頂脫毛備皮；2、大鼠腦定位儀固定大鼠，顱頂正中切口，長度約2cm開口暴露前囟及矢狀縫；3、縫線將皮膚左右分開固定，前囟后10mm、矢狀縫左側(cè)；4、微量注射器移至開孔處修正骨孔，注射器垂直向顱內(nèi)插入，緩慢注射無水乙醇15ul，注射完移除注射器，棉球壓迫止血；5、縫合創(chuàng)口后維持25°體溫，等待蘇醒，觀察大鼠狀態(tài)。【觀察】術(shù)后3天模型大鼠攝食減少、右側(cè)肢體跛行、右前肢不負(fù)重、右前肢及右前爪屈曲痙攣明顯。腫瘤細(xì)胞具有極強(qiáng)的增殖能力，在一個適宜,裸鼠成瘤是常見的驗證腫瘤細(xì)胞體內(nèi)增殖模型。上海病理科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)

動物疾病模型還為新藥研發(fā)和疫苗測試提供了有效的平臺。天津乳鼠科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建

    采用opti-MEM和Lipo3000分別轉(zhuǎn)染含有目的基因的pMSCV-eGFP、VSV、GAG質(zhì)粒及對照載體，每皿加入脂質(zhì)體-質(zhì)粒轉(zhuǎn)染混懸液按購買脂質(zhì)體相關(guān)說明書操作定量。繼續(xù)培養(yǎng)24h。2)24小時后，將培養(yǎng)基更換為新鮮的DMEM完全培養(yǎng)基，放進(jìn)細(xì)胞培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)48~72h。3)48~72h后收集上層培養(yǎng)液，并過μm濾膜，采用ELISA法對所獲得的慢載體進(jìn)行滴度測定。如不及時使用可以凍存于-80℃。3、慢轉(zhuǎn)染1)轉(zhuǎn)染前1天將細(xì)胞接種6孔培養(yǎng)板，時細(xì)胞的融合率約為50%，前需換液，加入1mLDMEM完全培養(yǎng)基。2)冰浴融化后加入相應(yīng)體積的液及聚凝胺（Polybrene），混勻后放入37℃孵箱中繼續(xù)培養(yǎng)3)4h后補(bǔ)充1mL培養(yǎng)基，14h后換液（24h內(nèi)換液即可）。4)72h后用倒置顯微鏡觀察熒光，監(jiān)測效率，出現(xiàn)較多熒光時將等量的轉(zhuǎn)染細(xì)胞和未轉(zhuǎn)染細(xì)胞分別加入等濃度Puromycin（Puromycin或其他篩選濃度需要事先摸索）。5)待未轉(zhuǎn)染細(xì)胞全部死亡并且可觀察到滿意熒光量時，降低Puromycin濃度培養(yǎng)。也可以挑去單克隆細(xì)胞株進(jìn)行進(jìn)一步培養(yǎng)，以得到滿意的穩(wěn)定表達(dá)目的基因的細(xì)胞株。6)使用qRT-PCR和Westernblot的方法檢測目的基因的表達(dá)量和蛋白水平是否顯著提高。7)由此可得三組細(xì)胞株：a.正常細(xì)胞株；b.空載載體的細(xì)胞株。天津乳鼠科研技術(shù)服務(wù)構(gòu)建