較早的抗體藥物根據(jù)雜交瘤技能,涉及動物免疫和細胞交融等過程,制備周期長、批間差異大。1985年,Smith創(chuàng)始了噬菌體展現(xiàn)技能,具體是將外源蛋白質(zhì)的DNA序列插入到噬菌體外殼蛋白的一個基因上,使外源基因跟著外殼蛋白的表達而表達,終究蛋白以與外殼蛋白交融的方式展現(xiàn)在噬菌體外表。被展現(xiàn)的蛋白或者多肽能夠保持相對的空間結(jié)構(gòu)和生物活性,因此能夠利用靶蛋白對其進行挑選。噬菌體外表展現(xiàn)技能直接略過了動物免疫和細胞交融過程,抗體來歷能夠跨越物種,還能夠進一步應(yīng)用于抗體親和力老練等,具有更加高效和高通量的特點。采用該技能已成功開發(fā)了全人源的抗體藥物即阿達木單抗。什么是高通量篩選技能?天然產(chǎn)物化合物篩選
藥物組合篩選的技術(shù)路徑涵蓋從高通量篩選到機制驗證的全鏈條。首先,基于疾病模型(如細胞系、類organ或動物模型)構(gòu)建藥物庫,包含已上市藥物、天然化合物及靶向分子等,通過自動化平臺(如機器人液體處理系統(tǒng))實現(xiàn)藥物組合的快速配制與劑量梯度設(shè)置。例如,在抗tumor組合篩選中,可采用96孔板或384孔板,將化療藥(如紫杉醇)與靶向藥(如EGFR抑制劑)按不同比例混合,通過細胞活力檢測(如CCK-8法)或凋亡標記物(如AnnexinV/PI雙染)評估協(xié)同效應(yīng)。關(guān)鍵實驗設(shè)計需考慮“劑量-效應(yīng)矩陣”,即固定一種藥物濃度,梯度變化另一種藥物濃度,生成協(xié)同指數(shù)(如CI值)熱圖,精細定位比較好協(xié)同劑量組合。此外,需設(shè)置單藥對照組與陰性對照組,排除非特異性相互作用干擾。對于復雜疾病(如神經(jīng)退行性疾病),還需結(jié)合3D細胞模型或斑馬魚模型,模擬體內(nèi)微環(huán)境,提高篩選結(jié)果的生理相關(guān)性。新藥篩選研發(fā)技術(shù)平臺怎么篩選先導化合物?
藥劑篩選面臨多重挑戰(zhàn),包括化合物庫質(zhì)量、篩選模型假陽性、活性化合物成藥的性能差等。首先,化合物庫中大部分分子可能缺乏活性或存在毒性,導致篩選效率低下。應(yīng)對策略包括構(gòu)建基于結(jié)構(gòu)的虛擬化合物庫,結(jié)合機器學習預測分子活性,減少無效實驗。其次,篩選模型可能因?qū)嶒灄l件波動(如溫度、pH值)或細胞批次差異產(chǎn)生假陽性結(jié)果。為此,需設(shè)置多重驗證實驗(如正交檢測、重復實驗)并引入陽性對照(如已知活性化合物)和陰性對照(如溶劑)。此外,活性化合物可能因溶解性差、代謝不穩(wěn)定或脫靶效應(yīng)無法成藥。可通過前藥設(shè)計(如酯化修飾提高水溶性)、納米遞送系統(tǒng)(如脂質(zhì)體包裹)或片段藥物設(shè)計(Fragment-BasedDrugDesign)改善其成藥的性能。例如,某抗ancer化合物因水溶性差被淘汰,后通過環(huán)糊精包合技術(shù)明顯提升其體內(nèi)療效。
場景3:方法學開發(fā)及驗證關(guān)于機制或表型雜亂的疾病,挑選之前開發(fā)適宜的挑選模型是試驗的重中之重,化合物庫可以用于新開發(fā)挑選模型的驗證。如Jong-ChanPark等科學家報道的一個根據(jù)信號網(wǎng)絡(luò)的高效阿爾茨海默病(AD)藥物挑選渠道,提出了數(shù)學建模和人類iCO相結(jié)合的精細醫(yī)療策略[4]。為了建立該渠道,作者團隊進行了三個過程:(i)從AD參與者中生成iPSC衍生的類組織(iCO)(源于11名參與者的1300個類組織被用于藥物評估渠道)。(ii)經(jīng)過對神經(jīng)元分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的剖析,提出了考慮神經(jīng)元動態(tài)的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)數(shù)學模型,進行了根據(jù)體系生物學的AD路徑數(shù)學模擬(包括信令網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、網(wǎng)絡(luò)模型驗證、操控節(jié)點識別等過程)。(iii)使用該挑選渠道對MCEFDA庫中的可透過血腦屏障化合物進行挑選,并經(jīng)過高內(nèi)涵挑選(HCS)成像體系定量AD發(fā)病程度,驗證了所建立的挑選模型的可行性,并得到一系列在AD醫(yī)治方面具有潛在使用價值的藥物。高通量篩選技能加速聯(lián)合用藥研討。
隨著生物技術(shù)和信息技術(shù)的飛速發(fā)展,新興技術(shù)為藥物組合篩選帶來了新的突破。機器學習和人工智能算法能夠?qū)Υ罅康乃幬飻?shù)據(jù)、疾病信息和生物分子數(shù)據(jù)進行分析和建模,預測藥物組合的潛在效果。通過構(gòu)建數(shù)學模型,模擬藥物與靶點、藥物與藥物之間的相互作用,快速篩選出具有協(xié)同作用的藥物組合。例如,利用深度學習算法對基因表達數(shù)據(jù)進行分析,挖掘與疾病相關(guān)的分子特征,從而預測能夠調(diào)節(jié)這些特征的藥物組合。此外,微流控技術(shù)的應(yīng)用也為藥物組合篩選提供了新途徑。微流控芯片能夠在微小的通道內(nèi)精確控制藥物濃度和細胞培養(yǎng)環(huán)境,實現(xiàn)高通量、自動化的藥物組合篩選。在芯片上可以同時進行多種藥物組合的實驗,實時監(jiān)測細胞對藥物組合的反應(yīng),很大提高了篩選效率。這些新興技術(shù)與傳統(tǒng)方法相結(jié)合,將推動藥物組合篩選向更高效、更精細的方向發(fā)展。怎么輕松批量篩選高質(zhì)量動物細胞RNA?多肽類產(chǎn)品篩選
針對新藥研發(fā)高通量篩選1小時究竟能挑選多少樣品?天然產(chǎn)物化合物篩選
未來,藥劑篩選將向智能化、準確化、綠色化方向發(fā)展。人工智能(AI)技術(shù)將深度融入篩選流程,例如通過深度學習預測分子與靶點的結(jié)合模式,加速虛擬篩選;利用生成對抗網(wǎng)絡(luò)(GAN)設(shè)計全新分子結(jié)構(gòu),擴展化合物庫多樣性。此外,類organ和organ芯片技術(shù)的興起,使篩選模型更接近人體生理環(huán)境,提升結(jié)果可靠性。例如,基于患者來源的類organ進行個性化藥物篩選,可顯著提高ancer醫(yī)療成功率。同時,綠色化學理念的推廣促使篩選實驗采用更環(huán)保的溶劑(如離子液體)和檢測方法(如無標記生物傳感器),減少對環(huán)境的影響。隨著技術(shù)的進步,藥劑篩選將更高效、更準確地推動藥物研發(fā),為全球健康挑戰(zhàn)(如耐藥性、神經(jīng)退行性疾病)提供創(chuàng)新解決方案,并重塑制藥行業(yè)的競爭格局。天然產(chǎn)物化合物篩選